Polemik surat bantuan Aceh ke PBB sempat memicu pro dan kontra karena dinilai melangkahi kewenangan pemerintah pusat. Gubernur Aceh Muzakir Manaf menegaskan telah terjadi kesalahpahaman dan menyebut surat itu bukan ditujukan ke PBB, melainkan ke UNDP dan UNICEF yang berkantor