Mikrotalasne pećnice spadaju među najčešće korišćene kuhinjske uređaje, ali istovremeno i među one koji se najbrže zaprljaju. Dovoljno je nekoliko sekundi da prskanje sosa, kipuća supa ili pregrejana hrana ostave uporne fleke i neprijatne mirise. Iako redovno brisanje može sprečiti veće nečistoće, ponekad je neophodno detaljno čišćenje kako bi unutrašnjost ponovo bila potpuno čista i sveža.