Njegova odanost vrhu SPC dovedena je u pitanje, jer je podržao studente sa još pet vladika februara prošle godine. Zbog tog čina u medijima su objavljenje informacije, da se na predstojećem Saboru sprema odvajanja Boke od Mitropolije crnogorsko - primorske kao i da se Eparhiji zahumsko - hercegovačkoj oduzme Dubrovnik. Vrh SPC se sigurno na taj korak nije odlučila da bi uspostavila bolju komunikaciju sa vjernicima već da bi poručila Joanikiju kako mora da se ponaša u momentu kada već godinu i po dana opada podrška režimu u Srbiji