في عام 1997، انتقل وحيدي إلى وزارة الدفاع تحت قيادة علي شمخاني، حيث شغل منصب نائب التخطيط والبرامج. وفي عهد وزير الدفاع مصطفى محمد نجار، عُيّن وزيرًا للدفاع وإسناد القوات المسلحة.