علی شمخانی از نخستین سال‌های پس از انقلاب در متن تحولات امنیتی و نظامی کشور قرار گرفت و با پذیرش مسئولیت‌های کلیدی در سپاه، ارتش و نهادهای راهبردی، به یکی از چهره‌های تأثیرگذار ساختار دفاعی ایران تبدیل شد. مسیر حرفه‌ای او از فرماندهی میدانی در سال‌های جنگ تا دبیر شورای عالی امنیت ملی، همواره با پرونده‌های حساس امنیتی و سیاسی گره خورده است.