Yağda çözünen bir besin öğesi olduğu için ana öğünlerle, tercihen sağlıklı yağ içeren bir yemek sonrası tüketilmesi hem biyoyararlanımı artırır hem de mide rahatsızlığı riskini azaltır. Sabah kahvaltısından sonra alınması, gün içinde enerji ve zihinsel performansı desteklemek isteyenler için uygun olabilir. Akşam saatlerinde tercih eden bazı kişiler ise omega-3’ün gevşemeye katkı sağlayabildiğini ve uyku kalitesini desteklediğini belirtmektedir. Önemli olan günün hangi saatinde alındığından çok, düzenli ve sürdürülebilir şekilde kullanılmasıdır. Kişinin yaşam tarzı, beslenme düzeni ve varsa sağlık durumu doğrultusunda en uygun zaman belirlenmelidir. Omega-3’ün etkileri kısa vadeli değil, uzun vadeli ve kümülatif bir süreçte ortaya çıkar. Bu nedenle her gün aynı saatte almak alışkanlık oluşturmayı kolaylaştırır ve doz atlama riskini azaltır. Ayrıca doz miktarı ve kullanım süresi bireysel ihtiyaçlara göre değişebilir. Yüksek trigliserid düzeyi, gebelik, emzirme dönemi, kronik hastalık varlığı ya da kan sulandırıcı kullanımı söz konusuysa mutlaka hekime danışılmalıdır. Takviye kullanımı kişiye özel planlanmalı; mümkünse öncelik doğal besin kaynaklarına verilmelidir.