Podporu zadržování vody v krajině coby součást protipovodňových opatření se nepodařilo plně zajistit. Ačkoliv ministerstvo zemědělství vydalo v letech 2020 až 2024 na tyto programy přes 7,1 miliardy korun, u tří z osmi kontrolovaných programů byly ze strany Nejvyššího kontrolního úřadu (NKÚ) zjištěny nedostatky. Ministerstvo zemědělství s výsledky kontrol nesouhlasí a připomíná, že opatření pomohla.