أرسى روح الله الخميني دعائم مؤسسة ولاية الفقيه، وتولى هو نفسه الولاية المطلقة، وله ما للإمام المنتظر عند الشيعة من صلاحيات، وسنّ دستورا بذلك في إيران ينقل الولاية بالانتخاب بعد وفاته، وكان يشترط بمن يتولى ولاية الفقيه أن يكون الأعلم. لكن بعد وفاة الخميني عقّد مبدأ “الأعلمية”