Ministerstwo Finansów miało zastrzeżenia do proponowanych przez resort rolnictwa form współpracy z Centralnym Ośrodkiem Informatyki (COI) przy tworzeniu KROPiK. Kolejne poprawki w projekcie były odrzucane. W takiej sytuacji Ministerstwo Rolnictwa i Rozwoju Wsi (MRiRW) zadeklarowało, że uruchomieniem bazy oznakowanych psów i kotów od początku do końca zajmie się Agencja Restrukturyzacji i Modernizacji Rolnictwa (ARiMR).